柬埔寨分海港和内河港，海港有西哈努克；内河港有金边、磅湛和磅清扬等。

一般货物进入到金边都需要从西哈努克港沿湄公河进入到金边港，由于湄公河上桥梁和本身旱季雨季不同水深的限制，过于大的船或是货物需要倒一次才能进入内河的金边港。

简称西港，位于柬埔寨西南海岸线上的西哈努克港，以西哈努克亲王名字命名。是柬埔寨最大的海港，首都金边外柬埔寨第二大城市，目前是全柬唯一一个经济特区，其地位类似于中国的“深圳”。西港建于1950年以后，为鼓励投资，1998年立为免税港。战乱时期西哈努克港曾改名为磅逊港，90年代又恢复了西哈努克港的名字。

虽是一个河港，却因优越的地理位置，成为柬埔寨第二大港口，每年吞吐量占全国的25%。金边港（PHNOM PENH）坐落在湄公河，是湄公河流域一个重要的杂货和燃料码头，是通过湄公河链接到中国海上通道的后江。金边港配备了两个浮动和两个处理能力达100吨移动式起重机，同时提供了充足的仓储设施和专业的工作人员管理这些设施。金边港是柬埔寨农产品出口国外的重要港口，除此之外，该港口是国外进口建材、电器与日用品的港口。